重庆交通大学科学城校区位于重庆江津双福新区福星大道1号，西侧紧邻福星大道，北侧紧邻规划的珊瑚大道，南侧紧邻福城大道，东面紧邻九龙坡区巴福镇。校区总建设用地面积2207亩（含李子湖），规划总建筑面积为85万㎡，2019年立项调整为65万㎡。

科学城校区建设主要分为三期完成。一、二期已建成投入使用，包含德园片区、教学综合楼、逸夫楼、学生活动中心、运动场、游泳池、风雨操场、土木学科组团、机电交运组团、西科所组团等，建设规模约32万㎡。三期一标段已建成投入使用，即礼园片区学生宿舍及食堂，建设规模约13.3万㎡。三期二标段设计总建筑面积15.7万㎡，建设内容包括图情中心组团、学院楼组团、体育设施组团、河海及后勤组团、西大门及西大门广场、校园环道及环境工程等。亚行贷款项目(三标段），总建筑面积3.2万㎡，建设内容为航空学院、航运学院和工程实训中心建筑及配套设施。